朱厚照沒有在劉府停留太久。
因為他擔心劉瑾利用手頭權勢招攬的軍將會鋌而走險，領兵攻打皇宮，稍有不慎皇位就要易主。
朱厚照平時只顧著吃喝玩樂，所以“禍事”到來心里沒多少底氣，在確定劉瑾謀逆是無可辯駁的事實后，就不想留下來繼續查看那些謀逆的證物，只想回戒備森嚴的皇宮等候事情結果，畢竟精神高度緊繃幾個時辰，一旦有所松懈，濃濃的倦意便襲來，他已經忍不住接連打了幾個呵欠。
等朱厚照離開，宮外的事情自然便由沈溪全權做主。
曹元和劉璟跟隨沈溪一起出門送朱厚照，目睹鑾駕離開后，劉璟試探地問道：“沈少傅，不知這案子……該如何查？”
“該怎么查就怎么查！”沈溪斬釘截鐵地道，“劉尚書，刑部作為三法司之首，對謀逆案有管轄權，你……”
“在下定全力配合沈少傅辦案！”劉璟主動表態道。
劉璟在朝中聲望不低，今年五十七歲的他，履歷極為豐富，不管是主政一方還是刑律軍事皆有建樹。劉璟心高氣傲，不覺得自己是閹黨成員，但還是在沈溪面前保持了足夠的恭敬，畢竟以朝中資歷來講，年少的沈溪還在他之上。
當初沈溪擔任兵部尚書時，劉璟尚為刑部左侍郎。
沈溪又看了曹元一眼，道：“閹黨當權時，附逆者甚眾，朝中有不少人歸附閹黨，但既然陛下有令在先，只有涉及謀逆之人才會被懲處，其余人等皆不予追究……兩位尚書乃朝中棟梁，本官剛回朝不久，查案還要多仰仗二位！”
“是，是！”
劉璟和曹元一臉喜色，俯首從命。
沈溪這才吩咐：“馬上派人去都察院和大理寺，讓兩司派精兵強將至刑部衙門，會同三司，集中審案。此番所有涉及劉閹謀逆的案子，都將在刑部衙門審結！那些閹黨成員，諸如劉閹幕僚……”
曹元搶先道：“在下曾臥底劉閹門下，對其幕僚和附逆官員知之甚詳，定不會讓一人落網……”
“嗯。”
沈溪點頭嘉許，“那就勞煩曹尚書幫忙將這些人的名字列出來，交由刑部發文捉拿歸案，不得讓其逃出城外。即刻起京師戒嚴，明日各城門不得開啟，等案情查清后，京師才可恢復正常。”
劉璟有些為難：“如此……是否太過大費周章？”
沈溪沒說話，曹元已開口：“如今閹黨蓄意謀反，若非陛下和沈尚書及時發現，或許已釀成滔天大禍，這時候城內實施戒嚴并封閉城門乃題中應有之意，如此才便于肅清閹黨余孽……”
這正是沈溪沒有第一時間把矛頭針對曹元的根本原因。曹元全靠劉瑾上位，在朝中沒有根基，必須要依附權貴。沈溪目前缺少幫手，給曹元一個希望，曹元必然處處以沈溪馬首是瞻，可以極大地方便沈溪行事。
沈溪道：“搜捕亂黨只能在一定范圍內行事，不得太過驚擾百姓，至于朝中依附閹黨的官員嘛……”
聽沈溪說到關鍵問題，劉璟和曹元都豎起耳朵，生恐漏掉一個字。
沈溪看了二人一眼，這才道：“具體事項，要等案情審結后交由陛下欽定，不過吏部尚書張彩……乃幸進之徒，短短數月便由正六品的吏部主事遷為六部之首的吏部尚書，霍亂朝綱，此獠為劉賊出謀劃策，殘害百官，貪財好色，實在是罪不可赦……”
聽沈溪說到具體人物，曹元心中一陣悲哀，在他看來，如果張彩被問罪，他也逃不掉，畢竟他是直接對劉瑾行賄，而張彩只是對行賄之事虛以委蛇罷了，本身張彩還反對劉瑾斂財并取得一定效果。
不過沈溪話鋒一轉：“但是，吏部尚書畢竟是部堂之首，倉促下獄太過難看，暫將張彩革職，看管于其府宅內，待查實罪證再予嚴辦，其余人等……先不忙計較！”
歷史上劉瑾案雖轟動一時，有不少人因此受到牽連，但因獲罪而死去的官員卻少之又少，這跟朱厚照下令只懲首惡有關。