雖然沒能像漫畫版中的同位體一樣搞出那么多‘大事件’來，但不可否認的是，漫威電影宇宙中的九頭蛇組織，同樣也是一家歷史悠久傳承有序的老牌反派恐怖組織。
其誕生時間，可以上溯到1400年前。
當時，東方的華國正處在隋唐時期，論國力，堪稱世界第一。
而在遙遠的西方，則是處在號稱‘黑暗時代’的中世紀，而且還是最為蒙昧，很多規則尚未形成的前期。
法蘭克王國、不列顛王國、東西哥特王國、拜占庭帝國等等勢力，林立于大地之上，互相之間打的跟熱窯似的。
彼時，即便是強盛一時的王朝帝國，也未必能在時代的大潮下幸免，而位于底層的平民大眾，那就更是不用說了。
越是讓人絕望的環境下，越是需要心靈上的寄托。毫無疑問，正處于‘黑暗時代’下的歐洲，正是宗教誕生及壯大的最佳土壤。
近乎于邪教的九頭蛇組織，就是在這樣的背景下誕生的——因為其領袖‘蜂巢’展示出了非常強大的能力，就如同圣經里描繪的那位‘萬能的主’，他手下控制的其他異人們，也各自擁有不同的異能，仿佛各路天使一般。于是，或者為了尋求他的庇護，或者是為了從他那兒借取力量為自己爭奪更多的好處，不少并沒有擁有異能的普通人也紛紛加入了這一組織。
異人們掌握上層機構，數量龐大的普通人組成了基本盤，九頭蛇組織的實力越來越大。最終，它們不僅深入了民間，許多貴族們也受到了拉攏。
只不過，這份蓬勃發展的勢頭，并沒有持續太久。
畢竟作為領袖的蜂巢并不是一位人格魅力超強，能夠吸引無數人死心追隨的人物。他之所以能夠成為頭領，完全是得益于自身的異能。
不善理政，全憑個人武力壓服手下……如果還是最初那個小團體，小打小鬧的搞事，當然沒問題。可隨著組織的日漸壯大，出現了更多的需求，需要照顧到的細節越來越多，以蜂巢相當于普通人的領導能力，自然不可能再繼續受到手下們的擁戴。
分配利益時無法讓眾人信服，平日里的所做作為，也透著不把手下當人看的輕視。忍得了一時，忍不了一世，隨著蜂巢一次次的倒行逆施，在九頭蛇的內部，終于爆發了大規模的反叛。
具體的過程就不仔細描述了，總之，在這一場事變中，蜂巢被放逐去了另一個星球上，從享盡了美食華服的‘教主’，淪落為了必須要啃土才能活下來的流浪漢。
反之，留在地球上的九頭蛇組織，也隨著那一場內戰，陷入了最為虛弱的境地——實力最強的蜂巢遭到了放逐，身負超凡能力的異人們，也一個個死的死傷的傷。剩下來的人里邊，大多都是沒什么特殊能力的普通人。
面對攻擊性越來越強的基督教勢力，這幫殘存下來的普通人，根本應付不來。
事實上，正是因為從蜂巢身上得到了教訓，那些原本跟隨了九頭蛇的貴族之中，有很大一部分反叛去了基督教一方。畢竟那邊只是嘴上喊著上帝之名，沒有誰真的見過上帝，反水去那邊，貴族們完全不用擔心會有所謂的神靈突然跳出來，搶走屬于自己的那塊蛋糕。
里應外合，給正在茍延殘喘的九頭蛇造成了巨大的壓力，于是，為了保住最后一點兒香火，最后那一部分死硬分子聚在一起開了個會，最終做出了決定，將九頭蛇徹底轉入了地下。