人類的工作在繼續，因為他們不知道下一名使徒什么時候降臨。
不過有一點可以確定，只要使徒降臨，那么一定會伴隨著羽戊良這只哥斯拉的亂入。
兩者之間不知道有什么聯系，但一定會伴隨著出現，不是人類的朋友，同樣將使徒視為敵人，甚至是食物，以使徒身上的“S2機關”為食。
“碇，看樣子，不知不覺已經走到了最終階段，你的計劃，看樣子要實現了啊。”
在NERV總部的秘密會議室中，僅有碇源堂和冬月耕造兩人，他們臉上都沒有太多表情。
“確實，但計劃并不百分百安全，至少在所有使徒沒有被消滅之前，并不是。”
碇源堂保持一貫冷冰冰的作風，雙眼凝視著前方。
“‘鑰匙’已經找到，也插入鑰匙孔中，甚至大門已經打開了一絲縫隙，但是……”
“這把‘鑰匙’還不夠純粹，不夠徹底！”
其實在與第九使徒和羽戊良對戰的時候，初號機差一點就完成了最后的覺醒，雖然可能會因此引起“第三次沖擊”，但這一切都是值得的。
而且碇源堂根本不在乎整個世界會變成什么樣，或者死多少普通人。
他要的結果只是計劃能夠順利完成！
冬月耕造看了一眼碇源堂，淡然道：“恐怕這一次我們時間不多了，初號機的駕駛員，你有何打算？”
“……”
冬月耕造所說的碇源堂心中有數，開口回道：“這是理所應當的，已經來了那么多使徒，全部無功而返，恐怕‘上帝’也會著急。”
“不用擔心，現在已經沒有人能夠阻止這一切，進化，勢在必行！”
想到碇真嗣，已經當時寧愿違抗自己命令也要喚醒前者的綾波麗，碇源堂眼中露出思索的神色。
這一切似乎脫離了碇源堂的計劃，但好像又全在他的掌握之中，不過面臨什么樣的情況，他依然保持那副冷漠的臉，處變不驚（真的不是面癱的關系？）。
“麗，你去休息一下吧？”
另一邊，左手打著石膏的葛城美里前來看望依然昏迷的碇真嗣，看到旁邊的綾波麗，關切地打招呼道。
因為綾波麗在關鍵時刻違抗了碇源堂的命令，導致原本應該覺醒的初號機沒能完成最終覺醒，因此受到了禁閉處分。
不過這個處分也只是形式上做個其他人看的，現在明日香下落不明，生死未卜，能夠駕駛EVA的駕駛員少之又少。
一旦使徒再次降臨的話，綾波麗還是要重新駕駛EVA披掛上陣的。
“美里小姐……”
看到是葛城美里，綾波麗露出淺淺的微笑，稍縱即逝，搖了搖頭，回道：“沒關系的。”
綾波麗的話語還是那么簡短，語氣中帶著一絲清冷，紅色的眼眸中看不出情感的波動。
葛城美里不再多說什么，目光轉向尚未蘇醒的碇真嗣。
由于初號機的原因，也不知道碇真嗣的情況究竟如何，目前從外表來看沒有什么問題，只能靜靜等待他醒來之后才能做出定論。
“嗯？”
突然，碇真嗣的睫毛動了一下，隨后緩緩地睜開了眼睛。
在碇真嗣的眼眸中，透露出一絲深邃，呆呆地看著天花板。
還不等驚喜的綾波麗和葛城美里開口，碇真嗣莫名其妙地說了一句：
“他（她？它？）來了。”