英宗即位以后，中外奏章皆委內閣簽辦，事務的決定全力在內閣手上，有助于皇帝減壓理政。
強化了明代的君主**；廢除宰相以后，六部分理庶務，大事由尚書主持的廷議決斷。但是內閣制度形成以后，首輔依靠皇帝來指揮六部，六部的權利漸次遭到侵蝕。
由于內閣只能依附于皇帝，擴大內閣的權利，也是在擴大皇帝的權利。
政治其實就是循環，廢相后，政治斗爭持續在中外朝、皇帝與內閣、內閣與六部、皇帝與中朝等等之間交錯其中。但是作為集權體制的核心，皇帝大多是處于掌控者的角色。
加上，內閣能否重用或者增減閣臣，取決于皇帝的個人意愿。
永樂時，閣臣是特簡，雖然后期的廷推影響了皇帝的獨裁，但是閣臣得不到皇帝的滿意，仍舊會被打回。
張居正主政期間，幾乎是獨操太阿，死了之后，內閣的權利立即下滑，可見此制度間接加強了君主**，君權無法節制。
大明的內閣還避免了獨裁之臣出現的幾率，這點上面，張居正是例外。
嚴格來說，張居正是個統籌者的角色，中朝和監護人皇太后履行著年幼的帝國君主的部分職權，所以內閣在此時權利很大。
皇帝成年以后，具有了單獨決斷龐大帝國行政事務時，就此一時彼一時了。
明代的內閣制度的缺點也很明顯，助長了君主的**內閣制度隨君權的高度強化而建立，權力的來源，由君主所授予，對君權根本就無節制的作用，事無大小，內閣都要秉承皇帝的旨意行事，遂成為皇帝加強**獨裁的工具，使明代的君主**比歷代為甚，助長了君主**。
形成了明代宦官的專權明代內閣因為欠缺法定的地位和權力，只是政務的補助機關，透過票擬、條旨來輔政，但大學士的票擬最后決定于皇帝的朱批，而明制以司禮監秉筆太監掌章奏文書。
宣宗時，大臣章奏除由皇帝親批數本外，皆由秉筆太監照內閣大學士之票擬批紅。
宣宗以后，人主怠荒，深居內宮，朱批便由秉筆太監處理，從此宦官透過司禮監的職務得以正式與外廷往來，宰輔之權便為內臣所侵奪，司禮監有太上內閣之稱，造成了明代宦官的專橫。
首輔有持相權而名不正的弊端內閣僅屬秘書機關，無宰相之名，也無宰相之位，更無宰相之責，但皇帝信任時，又確有宰相之權利。
明代內閣成立后不久，事實的演變，產生首輔，權利堪比中國古代宰相。
但此不過內閣中相沿的慣例，并非律定，故不為外廷所承認。
《明史紀事本末》說：“嚴嵩無宰相之名，而有宰相之權；有宰相之權，而無宰相之責。”正是說出了內閣制度的弊端。
內閣有相權而無宰相之責，出錯時便諉過他人，無宰相之名位而有宰相之權，則朝臣不能信服。
張居正任首輔，仍須與中官馮保結合才能執掌大權，方能施展抱負，就是很明顯的例子。
明代宦官之禍嚴重，內閣制度之名不正，有著密切的關系。
逐漸演變成朋黨的傾軋的搖籃內閣行使相權實在名不正言不順，容易造成內閣與外廷官僚的磨擦。
所以，魏忠賢有事沒事，遇到事情就愛推諉，推到內閣和出事的衙門之間，讓內閣和衙門自己協商解決，根本不讓事情捅到司禮監這一層面來，這才是最厲害的，會弄的出事衙門和內閣都沒轍。
“魏公公，我們現在就寫本子彈劾韋寶，陛下什么時候能批復？你們司禮監什么時候能批復、”楊漣問道：“不上朝，奏本總不能不批吧？”