軍隊的編制體制規模發生了重大變化，戰爭出現了許多新的特點，作戰指揮日趨復雜。原先三合一的簡單機構已經不能適應戰爭的需要，指揮體制必須變革。
拿破侖一生打了幾十個戰役，到了后期也感到無法統帥全軍了。
在1807年他任命曾在意大利方面參謀長的貝蒂埃為自己的參謀長。
貝蒂埃對參謀工作頗有研究，曾著有《阿爾卑斯普通參謀業務綱領》一書。
貝蒂埃經過一番潛心研究，向拿破侖提出了建立參謀處的設想，得到了拿破侖的支持。
1812年世界上第一個專門輔助統帥實施作戰指揮的參謀處產生了，作戰指揮較好地適應了當時戰爭的需要。
參謀處有參謀長領導，下設四科。第一科主管軍隊編制和實力，組織部隊移動和檢閱，搜集制定軍法，處理戰俘和逃兵等。第二科主管部隊裝備。第三科主觀偵察，制訂作戰計劃，組織通信聯絡和內務勤務。
隨著軍隊指揮的實施，司令部體制逐漸完善起來。
18至19世紀的歐洲兵制改革，實質上是武裝力量從私人化向國家化的轉變，軍隊實質上只是君主或領主的個人私兵而已，這個轉變是從“征兵制”的啟用開始的。
真正的革命性變化來自法國大革命，王室被推翻，已沒有“國王的軍隊”這個名份，而在反法同盟的圍攻下，戰爭性質轉變為“為保衛祖國”而進行的“人民戰爭”，不是為了騎士的榮耀，也不是為了賺錢，作為國家公民都有從軍義務，這個轉變其實很倉促，完全是迫于形勢，在“愛國主義”的精神感召下的自發行為。
通過法國大革命，所謂“民族國家”的理念開始占主導地位，國家的軍隊也即“人民軍隊”。
總之，從法國大革命到拿破侖時代，軍隊逐漸完成了向資產階級軍隊的演變。
在兵役制上，由雇傭兵制為主轉向了義務兵役制，基本實現了兵役面前人人平等的資產階級原則，拿破侖一世改造了法國革命所建立的軍隊，實行了普遍義務兵役制，建立了由步兵、騎兵和炮兵組成的師和軍，并且組建了強大的預備隊。
拿破侖在戰爭實踐中，始終把建設軍隊的問題擺在重要的位置，并力求建立一支能征善戰的強大的資產階級軍隊。
“欲治兵者，必先選將”。
拿破侖有一句名言：一支由馴鹿統帥的獅軍，決不可能再是獅軍。
并由此把將帥的選拔作為建立強大軍隊的重要條件。
在如何選拔將帥的問題上：他敢于起用新人，給年輕軍官創造機會。
據悉1805年由他晉封的18位元帥，多數在40歲以下，37歲以下的約有7人，而達武僅34歲。
同時，徹底破除了傳統的講究貴族出身的門閥觀念，注重唯才是舉。
這就是拿破侖的選帥標準：即注重年輕有為；力求不拘一格和強調素質才能。
“不想當元帥的士兵不是好士兵”。他曾說：“每個士兵的背囊里都有一根元帥的指揮棍”。提倡人人爭當將軍和元帥。
從1796年意大利戰爭開始，拿破侖就深刻體會到，決定戰爭勝負的主要是精神力量，而不是數量。