（新書期，求收藏！！求點擊！！求推薦！！）
黑流派忍術的修煉，主要分為身體和精神兩部分。
身體部分的修煉，除了基本的耐力訓練、靈活訓練、平衡訓練、力量訓練、體質訓練這五種修煉方式，以及配合念力使用的忍術的體術修行外，還有更為特殊的特殊技巧訓練，包括潛水，搏斗，暗器，劍道，化裝術，藥物術，施毒術，解毒術，隱匿術等等。
其中化妝術和隱匿術是忍者的特長，也是每一個忍者都必須掌握的兩門技術。
化裝術能制造人皮假臉，改換外貌性別，甚至高矮胖瘦美丑等的變幻也都不在話下，可以說一名足夠優秀的忍者，就是一個變幻莫測的易容大師，當得上“千面人”的稱號，像是霹靂劇中的服部中將，已經超越了忍術意義上的“化裝術”的層次，達到了“變假為真”的驚人造詣。
而隱匿術則是能最大限度的令忍者與四周環境有機融合，哪怕不動用高深的念法和武道修為，也往往能極為巧妙的躲開敵人的追蹤，避免被人察覺，一般的武者即便從他們身邊路過，往往也壓根就發現不了他們的存在。
至于精神上的修煉，那就是明顯出自佛門東密的修行方法。
原本的忍者是為軍事行動服務而誕生的軍種，類似于后世強化版的偵查特種兵，他們所執行的大多是一去不回的高風險任務，可以說每一次戰斗都是生死攸關的惡斗，既然是以性命相博的死斗，培養出來的忍者以及忍者本身當然希望能發揮自己全部的實力和潛力為生存而戰，這時就需要一種能夠激勵自己的精神依托和讓身體充分展現機能的催化劑，而東密的教義和修行方法正好滿足了這種需求，因此東密的修行法門受到了所有忍者的推崇和修習，并在之后完整融入忍道當中，發展出各種流派的忍術。
密宗認為人的身體有許多奧秘和潛能，只要通過密宗法門的不懈努力就能使修行者發揮全部潛力，讓身體與宇宙溝通達到天人和一的境界。另外，東密對于人體念力的開發，向來有著自己獨特的傳承，在密教界一直以顯著快捷著稱，忍者通過東密秘法的修習，錘煉自己的意志，精神變得無比純粹和堅韌，體內的潛能將得到最大限度的開發，可以完全除去心靈的迷惑和恐懼，全神貫注的投入戰斗。
因此，無論是哪種流派的忍術，都尤其強調精神上的修煉，并將其整個的訓練體系，建立在超乎想象的精神修煉核心之上，如此訓練出來的忍者，才能擁有在獨自一人在敵人的巢穴中完成任務，要克服對死亡、孤獨、黑暗乃至于饑餓、寒冷、傷病等諸多困難的精神依仗和身體催化劑，從而迸發出強大的精神和身體力量，換而言之，忍術之所以無堅不摧，變幻莫測的真正原因就在這精神訓練之上。
黑流派忍術作為東瀛忍術流派中唯一能和忍者發源地的伊賀派相抗衡的大型忍宗流派，其精神訓練的方法自然是深得東密修行法門的精髓，且還融入了東瀛本土的文化與武道精髓，更顯得精密奧妙，而其最核心的修行法門，正是密宗界大名鼎鼎的“三密加持”與“九會曼荼羅真言”。
“三密加持”是密宗修行的一個重要組成部分，包括身密（手結印契）、語密（口誦真言）以及意密（心觀尊佛）。
身密的主要修行就是“結手印”與“跏跌坐”。