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錫安在穩定了戰線之后，開始嘗試對收割者大軍發動反擊，兩條線路同時進行。
現實層面的目標是那些生產收割者和機械章魚的工業星球，主要目的是破壞生產線或者干脆將其收歸己有，會遭遇的敵人基本以機械章魚和收割者戰艦為主。
虛擬維度的目標則是一路破壞節點，爭取摧毀更多的控制中樞癱瘓矩陣的指揮系統，這邊的敵人，除了“特工”之外，則是來自各種“輪回世界”，造型和能力都奇奇怪怪的敵人。
這兩條線路的最終目標都直指矩陣的主機“grox”，從前者要花費的時間來看，基本等于徒步從地球前往太陽，雖然確實有威脅，但基本會被忽略不計。
而從虛擬維度出發，想要抵達主機在虛擬維度的節點的難度要低了不止一個數量級，畢竟在虛擬世界“距離”沒什么意義，但這種攻勢在難度上卻又極大，畢竟去收割錫安的矩陣部隊都處于“裝傻”狀態，虛擬維度分配給它們的資源極其有限，而如果這些不自量力的“覺醒者”以為那就是虛擬世界中的武力上限，并試圖通過虛擬維度對矩陣的主節點發起攻擊，全力全開的“grox”一定會讓他們知道什么叫地獄。
雖然可能在細節和用詞上不太一致，但以上內容應該就是矩陣方面的想法，它將不會對兩條戰線的任何一方進行增兵，可以說康娜的計劃已經成功了一半，但剩下的一半就要看硬實力。
最初之作一邊看著監控畫面一邊思考。
康娜跑來找自己的行為，像極了在某些即時戰略游戲里輸入全圖顯示的秘籍，雖然能獲得一定的優勢，但想以此獲勝的話難度依然不小，而且明明有“無限資源”、“加速建造”、“傷害增加”甚至“直接勝利”的“秘籍”可供選擇，但她卻不肯使用，非說要“打一場漂亮仗”給“即將再次休眠的姐姐”看。
這傻丫頭，明明曾經當過一陣子仿生人，但思考方式還是不夠縝密，如果她能打出“漂亮仗”并獲勝，中斷了收割者的收割循環，那自己就沒有必要繼續休眠，而如果她這仗會打輸雖然可能性很小自己這個“秘籍”就會啟動把她救下然后休眠，也看不到“漂亮仗”。
唯一能同時達成這兩種情況的可能，只有她打出“漂亮仗”即將獲得勝利，卻被某種超乎尋常且無法預測的外來因素破壞而突然失敗，自己不得不進行干涉然后進入休眠怎么想都是不可能的。
至于具體任務安排
留在“神堡”和“錫安”進行防守的人選有安吉拉、艾米爾、月詠神奈和伊莉雅，主要原因是她們擺在明面上的“復活級治療”、“午時已到”、“威力強大能夠自爆還能自行重組的機甲”、“原力”、“喝酒就能變成超強的大人”這種離譜的能力無法在矩陣內實現，但不知為什么更加離譜的“絕對防御”、“直死魔眼”和“無盡食欲”反而能使用多半是因為它們自帶“必然實現”的前提條件吧。
至于伊莉雅，則純粹是因為崔妮蒂不讓她去，而她又沒法拒絕她的“媽媽們”，救世主一家子剪不斷理還亂的家庭喜劇其實挺有趣，但畢竟是人家的，最初之作稍稍瞥了兩眼就放棄觀察再看下去，要么狗糧吃到撐，要么被甜掉牙。
現實層面主動出擊的人選則是安娜、山姆、御坂美琴、莉娜、卡奧斯、克多麗和奈亞。
安娜和山姆屬于標準的星聯軍人，在矩陣里用不出什么特殊能力治療手雷和睡眠針對特工又沒什么用。