童謠殺人案開篇講述了治安官邀請鐘先生去參觀一個古董飛船展覽。
導游介紹道,這艘古董飛船，不僅歷史悠久，而且出過一樁懸案。曾經的船主曾邀請十位客人上船進行星際航行,結果當這艘船自主返航時，這十位客人死了九位,其他乘客不知所蹤。
最詭異的是,乘客的死法都是按照一首童謠的順序。這首童謠在船內到處可見，全文還翻譯成不同版本鑲嵌在餐桌中心，似乎冥冥中自有天意。
“十個朋友九張椅,出局一個趴地底；
九個朋友八張椅,出局一個去倒立；
八個朋友七張椅，出局一個煙囪里；
七個朋友六張椅,出局一個在演戲；
一個朋友一張椅,獨占椅子思謎題。”
這首童謠源自藍星一個古老游戲“搶椅子”,當音樂停止,沒有坐到椅子的人就會出局,然后按這個歌實施相應懲罰。
治安官道“怎么樣大偵探帶你來對了吧。我猜你一定感興趣。”
鐘先生卻說“我早知道這樁案件的謎底。你要是想知道，我可以跟你分享。”
治安官“什么這么快就推理出來”
“并不，這是我人生第一件推理失敗的案件。”
鐘先生道出一個驚人秘密,
“我就是那個不知所蹤的乘客。”
鐘先生陷入回憶
“那年我十六歲,某一天抽獎抽中了這趟旅程。我以后才知道,我不是太幸運,而是被選中了。
我抽中獎太開心，就讓我的好友偷偷上船。
所以人們并不知道，真實里比傳聞中多了一個乘客”
十六歲的鐘先生,叫做小鐘；他的好朋友,叫做小時。
兩人天不怕地不怕,常在一起合作破案，是遠近聞名的少年偵探組合。這次小鐘收到一封邀請函，立刻讓小時跟著一起去，理由是他倆在旁人眼里本應是一體。
于是兩位少年上了這座華麗的古董船，同行的還有因為各種原因受邀前來的乘客，他們似乎都藏著各自的秘密。
大家上了船，才發現邀請他們的船主不在船上，只有仆人前來招待他們。仆人說船主會另行乘坐小飛艇上船，先讓古董船出航比較重要。
于是包括仆人在內的十一位乘客，進入了在太空中孤立無援的狀態。
因為乘客們性格不一，所以稍有摩擦。一行人吵吵鬧鬧地坐在餐桌上，結果一道電子聲音徹底打破平靜
“我是正義的法官，我將對你們實施審判。你們自以為處在黑與白之間，但正義的光芒會將你們凌遲。
高樹，你曾于虎年大年初一犯下謀殺吳麗之罪。
卡飛，你曾于兔年大年初二犯下謀殺查夜之罪
當然，你們之中存在絕對無辜者，歡迎我們的偵探，小鐘。
你將直接審判我的罪行。
愿正義的光環加冕于我們。”
永夜的名聲加上荀命的引流，童謠殺人案一經連載，就引起爆炸性的討論。
忠實的偵探迷們馬上做出人物關系圖。
xx是物理學家職業，被一個名為xx的業內好友邀請過來，但xx似乎失約了，電子音里，他殺的人叫做xx。
11個人物關系都列好，甚至小鐘本人也被列為未來的嫌疑犯。讀者們所有細節一條條做好筆記，就等著自己比永夜先猜出結局。
而且這次鐘先生親口承認，年少的他推理失敗了。
那自己要是推理成功，豈不是比鐘先生還厲害