他喃喃低語：“為什么？”他不知是在質問自己，還是在詢問正在駕駛座上欣賞這場煙花的萩原研二。
萩原研二聽見了柯南的聲音，他雖然還不清楚柯南的真實身份，但他可是有劇本臺詞的男人，于是在這個時候，他看著柯南那明顯受到震動的模樣，適時的念出了景原給他寫的臺詞：“這不是顯而易見的事情嗎？組織是不可能放任知道組織存在的外人活著的。或許你身邊有不知情的人，但這并不重要，反正死人是開不了口的。”
柯南終于在目睹了父母和灰原哀還有敬佩的跡部警官的死亡之后，深深的認識到了組織成員的危險性和可怖性。
雖然他鏟除組織的信念還是那么的堅定，并且更加渴望鏟除組織為今天犧牲在爆炸中的家人朋友們報仇。
但柯南也內心深切的后悔自己之前不夠謹慎的行為。
如果不是他暴露了身份，引來了‘波本’，他父母和灰原哀還有景原哥哥，都不會出事。
明明他已經從工藤新一變小成江戶川柯南了，他甚至可以讓自己工藤新一的身份假死，保護江戶川柯南這個身份。
但他偏偏要抱著僥幸心理，覺得事情不會那么糟糕，不會那么巧的被組織成員發現工藤新一的存在，最終落得這個地步，他想為死在剛才爆炸中的人報仇，可是他自己現在都落入了組織成員手里，能不能活下去都不一定呢。
柯南在后悔和絕望之中，干脆直接跟‘波本’攤牌了，以謀求一線生機：“像我這樣服用aptx4869之后不僅沒有死，反而變小了的例子，應該是非常罕見的吧？波本，你真的敢殺了我嗎？”
萩原研二：“……？”什么鬼？他按照景原給的劇本念臺詞，怎么念著念著就變成了柯南說出一些他聽不懂的話了。
什么叫吃藥變小？難道眼前這個七歲的江戶川柯南其實是一個年齡很大的人變小的嗎？
還有波本……波本是誰？他只知道波本威士忌這種酒。
等等，酒名？難道柯南以為他是那個以酒名為代號的黑衣組織成員‘波本’嗎？
只是打算給好友幫個忙演個劇本嚇唬嚇唬小孩的萩原研二，沒想到自己演到一半竟然被嚇到了。
原來這個劇本他看到的劇本內容并不是全部內容啊。
萩原研二的推理能力也非常強，在被柯南點破了關鍵之后，頓時就聯系到之前的那些沒被他注意到的線索。
失蹤了很久沒有再幫搜查三系目暮警部破案過的高中生名偵探工藤新一、之前配合他進行劇本演出‘被綁架’的工藤優作和工藤有希子夫妻倆、在黑衣組織臥底卻忽然出現在波洛咖啡廳當服務生打工的降谷零……
萩原研二慢慢的推測出了真相，或許柯南口中的那個‘波本’的代號，真正主人是降谷零那家伙。
而變小的話……工藤新一變小成江戶川柯南，就很容易解釋得通，為什么江戶川柯南父母經常不見蹤跡，在工藤夫婦回國前是寄居在毛利家，工藤夫婦回國之后就從毛利家回到了工藤宅，跟工藤夫婦住在一起。
工藤新一會變小成現在的七歲小孩，應該就是被黑衣組織成員逼著服下了aptx4869這種藥物。
黑衣組織成員應該是認為aptx4869可以殺人，要用這種藥物對工藤新一進行滅口，沒想到工藤新一竟然沒死，還返老還童了。
景原會請他幫忙嚇唬柯南，也很容易理解，畢竟萩原研二是親眼見過柯南在案發現場是怎么上躥下跳找證據調查破案的，表現得太高調，一點都不像是一個普通的小學生，很容易被人懷疑上。
景原希望柯南能夠長點教訓，低調一些，隱藏好自己的身份，于是邀請他和工藤夫婦一起演一出戲嚇唬柯南，讓柯南認識到嚴重性……這種推測完全合情合理。
萩原研二心里有了數之后，目光憐憫的看了柯南一眼，一個十七歲的高中生變成一個七歲小學生，的確有點慘。