高中生工藤新一在與自己青梅竹馬的伙伴毛利蘭去多羅碧加樂園游玩，卻因目睹黑衣人的交易而被喂下了一顆毒藥。
再次醒來身體卻莫名縮水，變成了7歲的小孩，江戶川柯南。從此他寄住在毛利偵探事務所，一直等待并找尋黑衣組織的線索，企圖一舉擊潰組織。
“那么工藤君，你現在變回來，是不是已經掌握了解藥”
世良真純迫切地看向工藤新一，“還是說你現在變回來的時間也是有限的，再過不久就會變回去”
她的情緒非常激動，應該是沒有想到月讀唯會將這一切這么快坦白告訴她。
“這確實不是永久性的，至于多久才會變回柯南”
工藤新一苦笑一聲，看向了灰原哀，“目前恐怕只有灰原有確切的估算。”
灰原哀見眾人將目光放在她身上，臉色更加不善。她瞪了眼月讀唯，“你可必須要保證我的安全，不然的話你旁邊的偵探先生可就一輩子要當個7歲的孩子了。”
“這話是什么意思”
世良有些懵。
灰原哀正了正身子，雙手之中略微發燙卻不至于讓人難以持握的茶杯讓她察覺到了身邊男人還有那么幾絲貼心。
“你口中的a藥，全稱為atx4869，又被稱之為「銀色子彈」，是組織在二十年前啟動，由我的父母一手研制，之后又交在我手上繼續研究的藥物項目。”
“這是一種能讓服藥者返老還童“逆轉時間”的藥物，但由于最開始的實驗階段，半成品的它還帶著毒性，可以使服藥者迅速死亡，并且死亡后尸體檢查不出死因和任何毒素，因此被那幫人廣泛當做殺人毒藥使用。”
灰原哀抬眼看了看那邊的少年，“至于工藤新一和我，是唯二的特殊情況，能夠在吃藥后沒有死亡，還縮小身體存活下來的人。”
“但是這種藥物雖然能逆轉時間，卻不能夠讓人的身體繼續生長。也就是說，一旦無法研制出解藥，你和我就要當一輩子的小學生了。”
她意指工藤。
乍聽此話，世良真純的手指忍不住微微縮緊，沉下來的眼神被對面的青年一覽無余。
“我想并不是唯二，而是
三才對。”
“我的母親，
也和你們一樣，
被喂下了這個藥，如今變成了國中生的模樣。”
聽到了母親的消息，赤井秀一的眼睛瞬間全部睜開，終于露出了如寒冰一般凌冽的雙眸。
“所以你那天從阿笠博士家中拿走藥物，就是想要驗證那是不是解藥對嗎”
工藤新一看向世良真純，追問道“你們是什么時候發現柯南和我有關聯的你的母親又是什么人怎么會被喂下這種藥物”
世良真純終于和盤托出，原來她在英國的時候就在電視報道上看到江戶川柯南的身影。又發現柯南出現的時機與工藤新一銷聲匿跡的時機剛好吻合，便懷疑了起來。
“我的母親叫做世良瑪麗，屬于i6的特工之一。至于其他的，我不方便跟你們多說。”
講到這，世良忍不住打量一眼對面的男人。
到現在她也不知道為什么小唯要把這個看似與組織毫無關系，一副好好先生的男人扯進這場會議來。
“昴先生，看來你已經知道我為什么要帶著世良登門拜訪的原因了。我想，現在應該沒什么好隱瞞了的吧”
月讀唯抿了抿涼得剛好的紅茶，開口向人說道。
瞇瞇眼的男人終于露出了他的真面目，將襯衫的前兩個扣子解開，露出了戴著脖頸的變聲器裝置，然后將其關掉。
“真純，好久不見了。”
短發少女的眸子一瞬間瞪大，幾乎以活見鬼的語氣，看著面前這個跟她大哥外表極其不符，但好像確確實實是她大哥的男人。
“秀哥”