軍營之中是人員高度聚集的區域，所以衛生狀況尤需注意，李泰對此當然不會松懈，諸營之中專設參軍督查此事，并且備有各種防治時疫的藥物。因此自從他所部人馬抵達東南以來，雖然軍中也有時疫染疾的情況發生，但都沒有形成大規模的傳播從而造成巨大的人員損失。
軍中尚可督令嚴整、準備周全，但是民間就不太好操作了。去年李泰從淮南合肥遷回的民眾中，由于對時疫的防治沒有足夠的重視，便有將近三千人先后染疾病死，這也給李泰敲響了警鐘，自此后便沒有再貿然進行大規模的人員遷移。
之前在關中的時候，當得知大行臺有意遷徙漢東民眾入關，李泰之所以心生抵觸，也有這方面的原因。
疫病可從來都不是戰亂年代的專屬，到了隋唐年間，關中地區仍然疫病頻發，這就與高頻率無規劃的人員遷徙有關。大量人口的遷入，也讓關中尤其是京畿周邊的人口過度集中，公共衛生因此變得頗為惡劣。再加上隋唐時期氣候升溫等各種原因，讓這個問題變得尤為嚴重。
如今的南陽盆地自然沒有達到關中那種人口密度，但是大量的人事流動則就難免，南面幾乎所有邊境城戍每天都會接收到數量不等的流民來附，而這些流人往往就會成為時疫病源。尤其是隨著時間進入盛夏，又到了時疫的高發期，這種情況就越嚴重。
荊州既不能閉關鎖境、拒絕接納流人，還要同外界進行頻密的人貨交流，是一個工農商綜合性的區域中心，所以就很有必要建立起一整套的公共衛生與防疫制度。
他首先劃定了三個區域，分別以石城、隨州與義陽為中心。凡邊境諸城戍所接收到的流人，統一送到這三城暫作安置，一邊進行造冊編籍，一邊進行隔離診治，確保時疫痊愈之后，再向沔北內陸輸送。
沔北因為新興了大量的工坊，這些工坊的匠人們都需要集中生產與生活，建立公共廁所與公共浴室也是應有之意。鄉里之間設立大灶，用以煮水蒸衣。
為了讓這一系列的事務能有一個系統性的管理，李泰還在總管府中特設疫醫曹，并將蔡陽城的李去疾召回擔任總管府治中并掌管疫醫曹事。疫醫曹下面又設有醫署、藥倉和康養堂，分別管理醫生、藥物和時疫病人。
這是一項需要全民參與的行動，行政機構和具體的規令既然都已經有了，接下來自然就是要進行全民推廣與普及。
對于新事物的接受和公益事務的熱情，無疑年輕人才是最高的。所以州學便成了第一個推廣的地點，當相關的防疫知識在州學中張貼出來之后，頓時便引起了眾多學子的圍觀。
“疫氣殺人，甚于刀兵。人唯自愛，疾病不生。勤于洗手，莫飲生水，勿隨地便溺”
類似的標語口號在州學中隨處張貼，學子們自感新奇之余，也都開始身體力行的去遵行其言，并且在離開州學后也都熱心宣傳，甚至在荊州城內外掀起了一場糾察運動，但凡道途有見行人暗處便溺，便手持竹杖入前擊臀。雖然是有幾分少年玩鬧惡作劇的意味，但卻有著為群眾掃除疫氣的大義。
疫病來勢洶洶、傳播迅猛，通常而言其實也并沒有什么太好的治療方法，無非增強個人的抵抗力，大多數情況都能自愈。