綱手繩樹和加藤斷先后死去之后便患上了恐血癥，然后便離開了木葉，混跡于某場所，成為傳說中的大肥羊。
重現木遁的實驗在木葉高層的默許下展開，卻又因為某些原因無疾而終，大蛇丸也因此有了所謂的黑點，與火影之位漸行漸遠。在三戰之后，大蛇丸便與志村團藏確立全面合作，但是大蛇丸也知曉志村團藏的尿性，因此便先一步地在東大陸忍界各地建立據點。
就在此時，大蛇丸本尊進入帝望，把即將叛逃的大蛇丸給拉進了千眼組織當中，于是大蛇丸便果斷地銷毀了所有證據，離開了木葉。只是大蛇丸雖然已經選擇離開木葉，志村團藏卻沒有打算放過他，暗中了各項證據，使大蛇丸依舊沒有逃過成為叛忍的命運。
正常來說，大蛇丸應該在四代目逝世以后不久就被志村團藏給出賣，然后叛逃。但因為御魂商團、千眼組織以及玩家們的影響下，這個時間點被向后推延了，所以大蛇丸的命運才會出現這樣的偏折。
在逼迫猿飛日斬退位以前，最有資格繼任的只有被稱為木葉白牙的旗木朔茂，以及三忍之一的大蛇丸，只不過大蛇丸在志村團藏的發揮下有了黑點存在，所以在志村團藏認為唯一有可能與他爭奪火影之位的，也就旗木朔茂一人而已。
因此，志村團藏設計陷害，并利用輿論對旗木朔茂進行傷害，再透過各種方式將其孤立，最終成功地使其心生死志，然后自裁逝世。
在大蛇丸成為所謂的叛忍以后，因為所有證據都是志村團藏所的，不管是猿飛日斬還是在來也，其實都心存疑竇，深深地懷疑這是不是志村團藏的手筆，于是在猿飛日斬的默許下，自來也踏上了追尋大蛇丸的旅程。
至于四代目火影波風水門的部份，這邊就不再次贅述了。
帝望日天帝國東大陸忍界的歷史發展軌跡雖然與原本的軌跡相仿，可細節之處卻是多有不同，但不管怎么說，木葉忍村當前的高端戰力幾近淪喪，卻是不爭的事實。
猿飛日斬沉默了片刻，卻開口問道〝可是事到如今，我們難不成還能把千眼組織往外推〞
〝既然千眼組織的兌閣下已然前來，本身就是對我們木葉的一種認可，要是這時候拒絕了千眼組織的要求，便會突顯出我們的虛弱和沒有底氣。〞就在猿飛日斬發問之際，外交一把手的轉寢小春便立刻給出了答案。
各大忍村其實都有著自己的眼線和間諜存在，想要知道其它忍村所發生的事情，只要不是太過于機密的情報，真心不是一件什么難事，差別只在于要花多久時間而已。
一但木葉顯露出底氣不足的模樣，各大忍村很快地便會心生異念，然后卷土重來，對火之國發起攻勢，這幾乎是必然的結果。
在場的木葉高層臉色一沉，他們自然能夠明白其中的險惡之處，但是眼前的狀況卻沒有給他們太多的選擇余地。猿飛日斬找他們來商議，與其說是在討論要不要接受千眼組織的請求，還不如說是找他們來商議該怎么搞好這一次的中忍考試和拍賣會，并防止其它忍村發現木葉此時外強中干的本質。
眾人沉默了許久，猿飛日斬卻是第一個開口說道〝我決定動員日向一族和宇智波一族的人手。〞