戰后第十六年七月上旬某日，東瀛國的長門級戰列艦“涼宮號”罔視唐國主權，正在唐國北方的北海海域進行演習，耀武揚威。
艦隊司令“長谷川”忽得該令部的緊急密電，急與另外四艘驅逐艦結成臨時編隊，星夜南下，追蹤某艘進入東瀛海域的黑色神秘艦艇。
依據泰西列強背書的永久和平條約，世界大戰之后的“海軍假日”里，列國削減海軍軍備，當今世界各國政府統共只保有七艘海上魔山般無堅不摧的戰列艦，稱為“七巨頭”，東瀛國有其二。
一者曰“長門”，一者曰“涼宮”，乃是東瀛的一對“長門級”姊妹艦。
考量火力、航速、防護等等各項指標，“長門”是人類綜合指標第一戰列艦，“涼宮”乃人類綜合指標并列第一的戰列艦。
這背后，凝結了東瀛付出舉國之力建造的心血除了工匠竭力，將士用命，另有皇族省吃儉用，典當金珠首飾，平民小學生忍痛交出壓歲錢，少女輟學為國赴南洋賣身籌款等等奇聞。
“漂洋之城兮衛櫻邦，無堅不摧兮真國寶
火炮轟鳴兮風雷催，皇國布武兮萬里濤”
到了次日午時，長谷川司令率領的涼宮艦隊即將返回東瀛國的“邪馬臺海峽”。繞過海峽，至首都瀛京便一路無阻。
軍樂團在涼宮號的甲板上鳴奏起了振奮士氣的海軍軍歌，敵就在附近
邪馬臺海峽氣候惡劣，經年濃霧不散。此時雖然旭日當空，海峽一帶黯淡無光，猶如陰曹地府礁石嶙峋，風高浪急，萬千怪聲回蕩，好似百鬼出沒。
十六年前的世界大戰，東瀛海軍就借此地地利設下陷阱，全殲了羅剎國陣營的遠東艦隊，讓米旗國陣營捏鼻子承認了東瀛新興大國的地位。
但即便到現在，東瀛艦隊本身也不敢再次輕入此地。
邪馬臺海峽一帶，無線電信號全部失靈，信號燈與瞭望員的作用也等同于玄學。
十六年前的勝利是天助神佑
十六年后是否仍有天助神佑，本代艦隊司令長谷川不得而知，但這次秘密任務，他帶了機關的級獵人調查員，特別領水員“城之內”。
憑著城之內的超凡能力“追蹤”，“涼宮號”就有了一對周知海域，讓敵人無所遁形的眼睛。
然后的一切就交給“涼宮號”的主炮吧。
長門級戰列艦長二百米，寬三十米，護甲可以承受上百發陸軍馬鹿的火炮炮彈。
她的四座雙聯裝16寸炮，射程五公里，火力足以轟平世界上的一切鋼鐵軍事要塞，何況是那艘小黑船。
“歐、歐、歐、歐”
濃霧里，時不時傳來海鳥的聲音。
城之內是一個嘴巴前凸的丑怪男，平常都帶著鳥嘴面具，他領一份機關的薪水，憑對艦隊的貢獻，從海軍部那再領一份津貼。
此時城之內已經發動了“追蹤”，出沒邪馬臺海峽一帶濃霧的海鳥都和他的精神網絡連接在了一起，
之前，城之內海鳥在這里發現了疑似黑船的物體，現在長谷川詢問他那艘黑船的詳細狀況。
城之內的眉頭緊鎖，斟酌道，
“那艘黑船像一條擱淺的鯨魚，躺在海峽的礁石叢里。”
長谷川司令臉色稍霽道，
“一個靶子而已。”
“但是，從黑船的上面，長出奇怪的珊瑚來，在海洋上增殖，有一片濕地森林那么密，附近水族正不斷被吸引過去，被黑船的珊瑚殺死、吸收
邪馬臺海峽在一點點染紅。”
城之內道。
“讓炎上號靠近，魚雷試探。”
長谷川司令下令，涼宮艦的信號燈向編隊的其他軍艦發出指令，四艘驅逐艦前出了一艘打先鋒。