第449章水之都，埋藏之塔，悠遠之悠
就在同一日的白天。
城都地區的南方海域中，水之都“奧多馬雷”。
它被譽為世界上最美麗的城市。城市之中，有著著名的建筑“大圣堂”以及“太陽之塔”。
這建筑，是人們懷著感恩傳說寶可夢守護了城市的心，而建造的。
而在這里，在城都地區旅行的小智，為了參加一年一度的寶可夢水上競賽而來到奧多馬雷，於是，遇見了擁有神奇招式的寶可夢，拉帝亞斯和拉帝歐斯。
拉帝歐斯是哥哥，擁有如天空和海一般的藍色。
拉帝亞斯是妹妹，擁有比夕陽更濃郁的火紅色。
它們彼此感情深厚，共同守護著城市的寶物“心之水滴”。
然而，怪盜姐妹桑娜和莉安盯上了這件寶物。
為了得到心之水滴，她們盯上了水都的雙子。
拉帝亞斯會幻化成名為卡儂的繪畫少女，在奧多馬雷的街頭玩耍與漫步。在某個有著水龍頭的小廣場中，小智和皮卡丘，與拉帝亞斯幻化的“謎之少女”相遇了。
伴隨著悠揚的手風琴音，謎之少女走入了錯綜復雜，又橫亙交錯的城市街道中，那宛如迷宮一樣的城市中。
而來自外界的女盜賊，用類似西爾佛檢視鏡的裝置，看穿了少女的偽裝，她們試圖抓住少女並逼迫她交出心之水滴。
而在這關鍵的時候，小智與皮卡丘穿越了迷宮，如命運般的邂逅，來到了陷入危機的少女面前，並將她從危機的環境中救出。
從那個時候，謎之少女便記住了這位帶著皮卡丘的少年。
三人來到了大圣堂，但是小智並不知道女賊的監視器已經盯上他了。進入圣堂，他們遇到了博物館的導游本葛雷先生。
忽然，小智注意到二樓有位少女正在收拾畫具，那正是剛才的少女！
小智決定一探究竟，他對小霞和小剛說有事情讓他們在寶可夢中心等他，跑出博物館，在看到少女之后他和皮卡丘追過去，此時飛行監視器跟上了小智。
循著少女的腳步，少年開始不顧一切的奔跑，跑出教堂，跑過橋樑，跑過若干條街道。
在一座橋邊，小智叫住了對面的少女，問她剛才為什么什么也沒說就跑掉了，但少女卻不知道他在說些什么。
少年也同樣不解，於是帶著皮卡丘繼續前進著，迷失在了城市的十字路口。
正當他不知該向何處尋找時。
募然回首，少女正在橋上靜靜的望看他。
繼續行進入小巷，小智越發奇怪也跟著跑進小巷。
穿過紫藤的長廊，在十字路口丟失了目標。
他開始漫無目的地尋找。正當他在一座橋邊感嘆這座城市簡直就是一座迷宮的時候，卻又看見了那個少女，不過她什么也沒帶。
少女微笑著跑向對面，招手示意小智跟上她。
異域風情的建筑，奔跑的少年，若即若離的少女，迷幻的手風琴，輕快的節奏，伴奏的音樂。
在那夏季的尾聲中，使訪客幾乎要融化在這朦朧的世界之中。
在經過一番追逐后，小智看到少女站在一堵墻前，陽光灑落在她的身上，樹影斑駁，隨后她微笑著，竟然穿過那堵墻消失了。
皮卡丘隨后也跟著進到了墻里，於是小智也下定決心穿過了那堵墻。
穿過隧道，小智和皮卡丘來到了一個美麗的園。
他繼續走過去，又看到了少女，他追上去，看到少女正在池塘對面盪著鞦韆。
少女是故意將少年引過來的。