崔呈秀被罷黜，朱由檢宣布朱燮元接替他的兵部尚書位置。朱燮元本來就有兵部尚書銜，資歷是夠夠的，但他當官幾十年基本都是在地方任職，很少待在朝堂上，大家對他并不熟悉。
直接說人家不夠資格不好意思，所以很多大臣以“朱燮元剛剛復任五省總督不久，西南情況不穩定，還需要他繼續鎮守”為理由，勸說皇帝另選他人。其中兵部的左右侍郎的反應最是強烈，好不容易熬走了崔呈秀這個惡心東西，他們也想進步。
“著朱燮元入閣，兼領兵部尚書，加太子太師銜。念爾勛勞，蔭其三子朱兆憲任錦衣衛指揮使，掌衛事，賜世襲誥券，世襲罔替，以彰殊恩。”朱由檢無視這些反對的聲音，直接宣布道。
眾臣為之震驚，已經顧不上阻止皇帝任朱燮元為兵部尚書了。大家現在都快酸成檸檬精了：皇帝你有太子嗎？就任太子太師！
朱燮元也被皇帝一連串的封賞嚇到了，于是他連忙匍匐在地說道：“臣本樗櫟庸材，謬膺閫外，賴陛下廟算如神、將士用命，始克蕩平逆氛。今蒙殊恩，位列臺閣，兼領樞務，復蔭及子孫，臣戰兢隕越，實不敢當，還請陛下收回成命！”
朱由檢則是借機說道：“愛卿不要謙虛，你配得上這樣的封賞。
當日奢安叛賊勢焰最熾之時，聚眾數十萬，席卷西南數省，連克大城。我大明損兵折將，無人能攖其鋒，賊勢猖獗至極，竟將成都合圍。
若非愛卿力挽狂瀾，固守成都，則禍事不堪設想，我大明險些失卻蜀地，幾至半壁江山淪喪。
愛卿總制五省兵馬，剿平叛寇，又安撫治理西南百姓，當真是活人無數。似愛卿這等戰功赫赫、政績卓著之忠臣，朕的這點封賞又算得了什么呢？
當年唐太宗定年號為‘貞觀’，‘貞，正也；觀，示也’，意為要以身當‘貞觀’，匡扶天下正道。
朕的年號是‘崇禎’，欲‘崇德象賢，迄用有成，維周之禎’。
朕才淺德薄，比不上大唐太宗皇帝，但也希望學習他的持正之道，有功勞的人必然會得到獎賞，犯錯誤的人必然會受到懲罰，或許這樣做才能夠重振我大明吧！
朕意已決，還請愛卿勿要推脫！”
這話，這群大臣信不信，朱由檢不知道，反正他自己是信了的。
朱燮元再拜，口中謝恩，行叩首禮接受了皇帝的封賞。
而后，朱由檢欽定首輔畢自嚴和武英殿大學士、兵部尚書朱燮元作為此次會試的主考官。
其實畢自嚴很忙，但是讓他百忙之中抽時間做主考官是很必要的。
無論是畢自嚴還是朱燮元，他們被皇帝驟然推到高位，但在朝堂上卻面臨著根基淺薄的窘境。一般來說，主考官和中舉考生之間會形成師生之誼，主考官將考生視為門生，考生稱呼主考官為師座。朱由檢就故意讓他們去培植黨羽。
當然，最后殿試的進士考生，也可以成為“天子門生”。
這些就像是老鄉會一樣，需要的時候可以用來攀關系，不需要的時候其實什么用都沒有，純粹就依靠個人發揮了。
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