剩下的事情就很簡單了，安德從NERV總部帶走了二號機，還有一具綾波麗的身體，然后就帶著弟子明日香，還有被他重新賦予人身的綾波麗回到了咖啡店。
與他一同跟來的還有葛城美里，這女人一直叫嚷著被他欺騙了感情，要好好找他算賬，路上喋喋不休，大多是在罵安德如何如何渣，如何如何傷害她的感情之類的。
安德表示與我無關，然后根本不鳥她，把她氣個半死。
現在情況就是這么個情況，安德吞噬了莉莉絲和亞當之后，使徒再也不是危險，而人類補全計劃也徹底流產，就算是現在殺了安德，這個計劃也不可能成功了，因為在前兩者被吞噬之后，莉莉絲與亞當只剩下靈魂，一位徹底變成的人類綾波麗，而另一個渚薰也徹底降格，墮落成了介于人于使徒之間的存在。
這種降格是不可逆的，人類補完計劃失去了成功的先決條件，從今往后擺在人類面前的就只剩下一條路，老老實實的攀科技樹，別想著再整個大計劃，了不起就是搞點戰爭的幺蛾子，但那已是與安德無關了。
有鑒于葛城美里太過嘮叨，安德直接就沒理她，讓她一肚子火卻沒處發，然后一發狠，就學明日香的做法，直接在安德這兒住下。
然后安德依舊沒理她，帶著明日香和綾波麗就去了實驗室，氣的她想罵人。
對于家里多了個葛城美里，明日香是無所謂的，反正她又沒辦法搶走安德的愛，明日香所在意的是綾波麗，這個走后門的為什么會住在老師家里？而且老師還成了她的監護人？
對于這一點，明日香是非常在意的。
“老師，我是你的弟子吧？”
“嗯？”
“我可愛吧？”
“嗯？”
“我一直很乖巧吧？”
“嗯？”
“那我能不能提個小小的要求啊？”
“你想說什么？”
“把這個走后門的趕走怎么樣？”
“你在想屁吃。”
“啊啊啊，老師我不喜歡你了，你傷害了我。”
“哦。”
安德進行著手上的工作，理都懶得理，然后明日香不爽了，就想去找綾波麗的麻煩，可惜后者是個三無，任由明日香如何說，綾波麗就是不理，更是氣的明日香牙癢癢。
“身體年齡應該在三十二歲左右，相貌的話，跟綾波麗有七成相似，茶色頭發，身高是多少來著？算了，就設定成176cm吧，至于碇源堂受不受得了，那就不是我的事了。罩杯……呃，算了，就這樣吧，其余什么的，一切從簡，至于他收到貨會說我老婆怎么縮水了？那跟我有個毛線關系。”
沒錯，安德現在就是在催熟綾波麗的克隆人身體，將之改變成碇唯的模樣，既然答應了人家再看到老婆的愿望，那就要說到做到。
做完這一切，安德就把初號機給拆了，拆的很徹底，直接將初號機的肉身粉碎，化成最精純的lcl液，感受著其中那近乎消散的靈魂，他直接動用身為造物主的能力，將之補完，使之恢復到正常狀態。
造物主的能力怎么說呢？對安德來說，就是奇怪的知識增加了，很好用，但也僅是如此了，并沒有什么秒天秒地秒空氣的能力。
碇唯的新身體，本身就是以她的基因為藍本克隆出來的，所以與靈魂的契合度極高，加上安德的手段，成功將碇唯的靈魂放進了新身體中，然后就是等著其自然蘇醒了。
畢竟是死了十多年的人，靈魂以量子狀態存在于二號機體內，只有近乎本能的一些反應，要與新身體完全融合，這是需要點時間的。
好在這個時間并不長，不過大半天的時間，碇唯就醒了過來。
“嗯……”